如何基于Python Matplotlib實(shí)現(xiàn)網(wǎng)格動(dòng)畫(huà)
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如果你對(duì)本文的代碼感興趣,可以去 Github (文末提供)里查看。第一次運(yùn)行的時(shí)候會(huì)報(bào)一個(gè)錯(cuò)誤(還沒(méi)找到解決辦法),不過(guò)只要再運(yùn)行一次就正常了。
這篇文章雖然不是篇典型的數(shù)據(jù)科學(xué)類(lèi)文章,不過(guò)它涉及到數(shù)據(jù)科學(xué)以及商業(yè)智能的應(yīng)用。Python 的 Matplotlib 是最常用的圖表繪制以及數(shù)據(jù)可視化庫(kù)。我們對(duì)折線圖、柱狀圖以及熱力圖都比較熟悉,但你知道用 Matplotlib 還能做簡(jiǎn)單的動(dòng)畫(huà)嗎?
下面就是用 Matplotlib 制作動(dòng)畫(huà)的例子。展示的是 John Conway 的 《The Game of Life》,這是一個(gè) Metis(數(shù)據(jù)科學(xué)夏令營(yíng))中的編程挑戰(zhàn)題目,同時(shí)給了我一個(gè)機(jī)會(huì)來(lái)制作我的第一個(gè) Python 動(dòng)畫(huà)。看看結(jié)果的動(dòng)圖:
這篇文章的重點(diǎn)還是主要放在 python 中如何用 Matploylib 制作動(dòng)畫(huà)。
但如果你不太熟悉模擬游戲的話(huà)(它更像是可以看的模擬動(dòng)畫(huà),而非可以玩的游戲),我來(lái)給大家介紹一下規(guī)則:
一開(kāi)始先設(shè)置一個(gè) N×N 的網(wǎng)格(我的動(dòng)畫(huà)中用的是 50×50 ); 接著隨機(jī)地向格子中填充“小細(xì)胞”(一開(kāi)始隨機(jī)地從 2500 個(gè)格子中選取 1500 個(gè)進(jìn)行填充); 如果鄰居小細(xì)胞少于等于 1 個(gè),那格子中的小細(xì)胞會(huì)死掉; 如果鄰居大于等于 4 個(gè)的也會(huì)死掉; 只有 2 個(gè)或 3 個(gè)鄰居時(shí)可以生存; 空的格子中如果正好有 3 個(gè)鄰居,則會(huì)長(zhǎng)出 1 個(gè)新的“小細(xì)胞”;—2—
建立網(wǎng)格
我們首先導(dǎo)入所需的庫(kù)。
import timefrom IPython import displayimport matplotlib.pyplot as pltimport matplotlib.animation as animation
我們會(huì)利用Matploylib 動(dòng)畫(huà)模塊中的 FuncAnimation() 函數(shù)。 FuncAnimation()是通過(guò)多次調(diào)用一個(gè)函數(shù)并逐次更新圖片來(lái)實(shí)現(xiàn)讓圖片動(dòng)起來(lái)的。我們來(lái)一步步地實(shí)現(xiàn)這個(gè)過(guò)程。
但首先,我們需要先初始化我們的網(wǎng)格。下面的幾行代碼用來(lái)存儲(chǔ)我們輸入的數(shù)據(jù):
我們需要一個(gè) 50×50 大小的網(wǎng)格; pad 變量可以使得計(jì)算鄰居變得更容易。通過(guò)在邊界外添加一層空白格子,我們就不需要額外再寫(xiě)一個(gè)邏輯來(lái)處理網(wǎng)格的邊界。因此我們 50×50 的網(wǎng)格其實(shí)是被一圈空白格子包圍著,這使得實(shí)際的 numpy 序列的大小為 52×52; initial_cels 變量表示在網(wǎng)格啟動(dòng)的時(shí)候我們想要多少“小細(xì)胞”。他們會(huì)被隨機(jī)地分布在網(wǎng)格上。# Input variables for the boardboardsize = 50 # board will be X by X where X = boardsizepad = 2# padded border, do not change this!initial_cells = 1500 # this number of initial cells will be placed # in randomly generated positions
接下來(lái)我們隨機(jī)地生成一系列“小細(xì)胞”的初始坐標(biāo)(上面我們選擇了 1500 個(gè))。把這些坐標(biāo)存儲(chǔ)在 pos_list 變量中。
# Get a list of random coordinates so that we can initialize# board with randomly placed organismspos_list = []for i in range(initial_cells): pos_list.append([random.randint(1, boardsize), random.randint(1, boardsize)])
然后我們是時(shí)候該初始化網(wǎng)格了。我們會(huì)用一組叫 my_board 的 numpy 序列來(lái)代表我們的網(wǎng)格——我們先生成一個(gè) 52×52 數(shù)值為 0 的矩陣序列作為開(kāi)始(比 50×50 大是由于增加了空白邊緣),然后調(diào)用 init_board() 函數(shù)來(lái)根據(jù) pos_list 中的坐標(biāo)把“小細(xì)胞”填充到網(wǎng)格中。輔助函數(shù)的具體細(xì)節(jié)我不再展開(kāi)講了,不過(guò)我把他們都整理到我的 Github 上了。
# Initialize the boardmy_board = np.zeros((boardsize+pad, boardsize+pad))my_board = init_board(pos_list, my_board)
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制作網(wǎng)格動(dòng)畫(huà)
這是我們最期待的部分——?jiǎng)赢?huà)!首先,我們需要完善一些配置。下面的幾行代碼用來(lái)生成展示我們動(dòng)畫(huà)的 mtplotlib 圖框。
# Required line for plotting the animation%matplotlib notebook# Initialize the plot of the board that will be used for animationfig = plt.gcf()
接下來(lái)制作我們的第一幀。 mtplotlib 中的 imshow() 函數(shù)可以接收一組 numpy 矩陣然后返回一張圖片。很酷吧!
# Show first image - which is the initial boardim = plt.imshow(my_board)plt.show()
傳入 imshow() 的變量是我們的初始的網(wǎng)格 my_board。生成的圖片長(zhǎng)這樣:
現(xiàn)在我們需要寫(xiě)一個(gè)可以給 FuncAnimation() 調(diào)用的輔助函數(shù)。 animate() 函數(shù)接受一幀畫(huà)面作為輸入充當(dāng)計(jì)數(shù)器。這個(gè)畫(huà)面計(jì)數(shù)器就是 FuncAnimation() 和 animate() 函數(shù)溝通的橋梁——在每一個(gè)時(shí)間點(diǎn)(也就是每一幀),它都會(huì)調(diào)用一次 animate()。然后 animate() 會(huì)逐次使用輔助函數(shù) update_board() 來(lái)對(duì)網(wǎng)格進(jìn)行迭代。最后, set_data() 函數(shù)將圖片更新為迭代后的網(wǎng)格,這就完成了。
# Helper function that updates the board and returns a new image of# the updated board animate is the function that FuncAnimation callsdef animate(frame): im.set_data(update_board(my_board)) return im,
一切順利!我們準(zhǔn)備調(diào)用 FuncAnimation() 函數(shù)了。注意輸入的參數(shù):
fig 是我們?cè)谇懊鎰?chuàng)建的用來(lái)裝載我們的動(dòng)畫(huà)的圖形變量; animate 是 FuncAnimation() 用畫(huà)面計(jì)數(shù)器進(jìn)行溝通的函數(shù)(自動(dòng)傳入,不需要特別聲明) frames 表示我們希望動(dòng)畫(huà)持續(xù)多少幀,在這里我們想要?jiǎng)赢?huà)的長(zhǎng)度為 200 幀; interval 表示每一幀之間間隔的毫秒數(shù)。我們想要每幀之間間隔 50 毫秒。# This line creates the animationanim = animation.FuncAnimation(fig, animate, frames=200,interval=50)
就這么簡(jiǎn)單!不是很難吧?為了慶祝我們成功制作動(dòng)畫(huà),我再送大家一個(gè)動(dòng)畫(huà):
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總結(jié)
希望這篇文章能幫到大家。在結(jié)束之前,讓我來(lái)幫助大家腦補(bǔ)更多我們今天學(xué)到的動(dòng)畫(huà)功能在數(shù)據(jù)科學(xué)上的應(yīng)用:
一個(gè)個(gè)地畫(huà)出蒙特卡洛模擬數(shù)據(jù),你能觀察到最終的分布是如何逐步形成的; 按順序遍歷時(shí)間序列數(shù)據(jù),可以描繪你的模型或數(shù)據(jù)在新的觀察角度下有什么表現(xiàn); 當(dāng)你改變輸入?yún)?shù)時(shí),比如族群數(shù),可以展現(xiàn)你的算法是如何劃分族群的; 根據(jù)時(shí)間或不同的數(shù)據(jù)子集生成關(guān)聯(lián)熱力圖,用于觀察不同的樣本是如何影響你的模型的預(yù)期參數(shù)的。以上就是本文的全部?jī)?nèi)容,希望對(duì)大家的學(xué)習(xí)有所幫助,也希望大家多多支持好吧啦網(wǎng)。
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